دانشکده ادبیات و علوم انسانی، گروه‌های آموزشی: زبان وادبیات فارسی- زبان و ادبیات عربی- زبان‌های خارجه(در رشته ادبیات) و تاریخ - جامعه شناسی - علوم قرآن و حدیث فلسفه - معارف اسلام (در رشته علوم انسانی و اجتماعی) را دارد و چشم انداز آتی آن: ارتقاء رتبه دانشکده به سطح 5 دانشکده اول در حوزه علوم انسانی کشور، تبدیل دانشکده از یک سازمان یاد دهنده صرف به یَژَک سازمان یادگیرنده مستمر، تقویت سنت گفتگو در سطوح مختلف مناسبات میان افراد به عنوان مبنای فهم و عمل مشترک، کاربردی کردن دانش علوم انسانی در جهت شناسایی مشکلات کشور و چاره جویی از آن، رشد و پرورش فرهنگ آکادمیک (دانشگاهی) در سطح دانشکده، گام برداشتن در مسیر بین‌المللی شدن، رعایت اصل انتقادپذیری، حقیقت گرایی، احترام به آزادی آکادمیک و صداقت علمی و تلاش علمی و عملی برای گسترش صلح و عدالت فراگیر است.

دانشکده اقتصاد یکی از دانشکده های دانشگاه علوم اقتصادی ، با چند دهه سابقه موثر در آموزش عالی کشور ،‌ بود که پس از ادغام آن در دانشگاه خوارزمی ، همچنان به فعالیت آموزشی دیرینه خود ادامه می دهد. اکنون بیش از 500 دانشجو در مقاطع کارشناسی و کارشناسی ارشد دراین دانشکده مشغول تحصیل بوده و اغلب دانش آموختگان آن در سازمانهای اقتصادی و مالی کشور منشا اثر هستند.

پردیس بین الملل دانشگاه خوارزمی با هدف توسعه آموزش عالی در مقاطع تحصیلات تکمیلی بر اساس قانون ایجاد شده است. پذیرش دانشجو در پردیس بین‌الملل از طریق آزمون سراسری سازمان سنجش صورت می‌گیرد. در حال حاضر پردیس بین‌الملل دانشگاه خوارزمی در رشته‌های مختلف علوم انسانی، فنی و مهندسی و علوم پایه در مقاطع کارشناسی ارشد و دکتری دانشجو می‌پذیرد.

.دانشکده تربیت بدنی در دو ساختمان در تهران و کرج فعال می باشد. دانشکده در کرج شامل ساختمان آموزشی و اداری و چهار سالن ورزشی، یک استخر سرپوشیده و یک زمین چمن می باشد استخر دانشکده تربیت بدنی جزو اولین استخرهای استاندارد کشور است. همچنین دارای چهار آزمایشگاه تخصصی در رشته های بیومکانیک و حرکات اصلاحی، فیزیولوژی ورزشی و آزمایشگاه رفتار حرکتی و همچنین کتابخانه تخصصی می باشد. ساختمان دانشکده در تهران واقع در مجموعه ورزشی و فرهنگی شهید کشوری شامل ساختمان اداری و آموزشی، سالن ورزشی، کتابخانه تخصصی و مرکز کامپیوتر است و مخصوص دانشجویان کارشناسی ارشد و دکتری می باشد

دانشکده حقوق و علوم سیاسی با تصویب هیأت امنای دانشگاه، در سال 1394 از دانشکده ادبیات و علوم انسانی تفکیک گردید و دارای 5 گروه آموزشی حقوق جزا و جرم شناسی ، حقوق خصوصی ،حقوق بین الملل ، علوم سیاسی و روابط بین الملل می باشد. این دانشکده دارای حدود 600 نفر دانشجو در هر سه مقطع و تعداد 27 نفر عضو هیئت علمی که شامل 1 نفر استاد تمام، 7 نفر دانشیار و 19 نفر استادیار می ‌باشد. این دانشکده در راستای توسعه ی فعالیتهای میان رشته ای خود در حال راه اندازی رشته های جدید می باشد.

همزمان با تاسیس دارالمعلمین مرکزی، موضوع‌های تربیتی ویژه‌ای مانند فلسفه، منطق و اصول تعلیم به دانشجویان تربیت معلم ارائه می‌شد و در سال ۱۳۱۲ برای اولین بار موضوع‌هایی مانند تعلیمات متوسطه، تاریخ آموزش و پرورش، اصول آموزش و پرورش، فلسفه آموزش و پرورش، روانشناسی پرورشی و جامعه شناسی به داوطلبان دبیری تدریس شد و آزمایشگاه‌های روانشناسی و علوم تربیتی تأسیس گردید. بدین ترتیب هسته اولیه دانشکده علوم تربیتی با بخش‌های آموزش و پرورش ابتدایی، تربیت بدنی و روانشناسی تشکیل شد. پس از تبدیل دانشسرای عالی به دانشگاه تربیت معلم، به طور رسمی دانشکده‌های علوم تربیتی و مؤسسه تحقیقات تربیتی به وجود آمد.

دانشکده شیمی در سال 1375 تاسیس شد و فعالیت آموزشی و پژوهشی خود را ضمن تغییر قالب گروه به دانشکده ادامه داد. در حال حاضر این دانشکده 26 عضو هیئت علمی شامل 4 استاد، 7 دانشیار، 14 استادیار و یک می باشد. دانشکده مشتمل بر هفت گروه آموزشی شیمی فیزیک، شیمی معدنی, شیمی تجزیه، نانوشیمی، شیمی کاربردی، شیمی آلی و پلیمر و فیتوشیمی است. دانشکده در پردیس کرج دارای 2500 متر مربع زیربنا، مشتمل برکلاس های درس، آزمایشگاه های آموزشی و تحقیقاتی، اتاق دستگاه های آنالیز، اتاق کار اعضای هیأت علمی و مدیریت دانشکده است. ساختمان جدید دانشکده در پردیس کرج با زیربنای 5000 متر مربع در حال ساخت می باشد. در تهران نیز دارای زیربنای 800 مترمربع مشتمل 5 آزمایشگاه تحقیقاتی، اتاق های اساتید و دفتر دانشکده است.

با توجه به پتانسیل‌های خاص دانشگاه خوارزمی، به عنوان یکی از دانشگاه‌های مادر و سابقه درخشان دانشگاه در عرصه‌های مختلف علمی، دانشکده هنر و معماری دانشگاه در سال 1395 با راه‌اندازی دو رشته معماری و شهرسازی تأسیس شد. دانشکده هنر و معماری می‌تواند خلاء های موجود در زمینه هنر و معماری به خصوص در مباحث بنیادی و نظری را مرتفع نموده، زمینه‌های گسترش این مهم در سطح منطقه و به خصوص جهان اسلام را فراهم آورد. با توجه به خلاء های موجود در زمینه آموزش و پژوهش هنر و معماری، پتانسیل های ویژه و منحصر به فرد دانشگاه خوارزمی که زمینه هم‌افزایی بین رشته ای را فراهم می آورد، دانشکده هنر و معماری در دانشگاه خوارزمی می تواند گام موثری در راستای نظریه‌پردازی و دستیابی به اهداف والای فرهنگ ایرانی- اسلامی باشد.

آموزش مشترک تاریخ و جغرافیا در دانشگاه خوارزمی بطور رسمی از سال‌ 1307 در «دارالمعلمین عالی» آغاز شد. در سال 1318 نخستین گروه علمی جغرافیا در ایران و در دانشگاه تربیت معلم تهران تأسیس شد. پس از آن، با طرح توسعه گروه، دانشکده علوم و فنون جغرافیایی تأسیس شد. دانشکده علوم جغرافیایی هم اکنون در رشته ها و گرایش های علوم جغرافیایی در تمامی مقاطع تحصیلی مشغول به فعالیت است و از امکانات و تجهیزات آزمایشگاهی-کارگاهی نسبتاً مناسبی برخوردار است.

در دانشگاه خوارزمی، تشکیل یک گروه ریاضی منسجم همزمان با تاسیس موسسه ریاضیات اتفاق افتاد. سپس گروه ریاضی به دانشکده علوم ریاضی و مهندسی کامپیوتر با رشته های ریاضی محض، ریاضی کاربردی، آمار و مهندسی کامپیوتر (نرم افزار) ارتقا یافت و رشته های علوم کامپیوتر و رمز در این دانشکده تاسیس شد و رشته مهندسی کامپیوتر (نرم افزار) به دانشکده تازه تاسیس فنی و مهندسی انتقال یافت و نام دانشکده به دانشکده علوم ریاضی وکامپیوتر تغییر یافت.

پیشینه تأسیس رشته زمین‌شناسی در دانشگاه خوارزمی به تأسیس رشته علوم طبیعی متشکل از زمین‌شناسی و زیست‌شناسی بازمی‌گردد. حضور اساتید به نام و برجسته این حوزه سبب شد گروه زمین‌شناسی یکی از گروه‌های پیشگام در برنامه‌ریزی و اجرای دوره تحصیلات تکمیلی در کشور به حساب آید. با توجه به فعالیت‌های آموزشی و پژوهشی گروه و گستردگی کار و تغییرات سیاست‌های دانشگاه، گروه آموزشی زمین‌شناسی به دانشکده ارتقاء یافت. در حال حاضر این دانشکده شامل سه گروه زمین‌شناسی، زمین‌شناس کاربردی و ژئوشیمی می‌شود.

دانشکده علوم زیستی دارای 4 گروه آموزشی که شامل : 1- گروه علوم جانوری 2-گروه علوم گیاهی 3- علوم سلولی و مولکولی 4- گروه درحال تأسیس محیط زیست می باشد که هرکدام استقلال خاص خود را دارند. این دانشکده با داشتن 30 عضو هیأت علمی دارای دو معاونت آموزشی و پژوهشی می باشد. در سال های اخیر دانشکده علوم زیستی چندین قرارداد تفاهم نامه با مراکزی نظیر مرکز ملی ذخائر ژنتیک،دانشگاه پیام نور، مؤسسه سرم سازی رازی، پژوهشگاه رویان و همچنین نیروی انتظامی مبارزه با مواد مخدر ( ناجا) امضا نموده و همکاری های وسیعی در جهت پیشبرد طرح های پژوهشی و تبادل دانشجو در جریان است. این دانشکده دارای چهره های شاخص در زمینه چهره های ماندگار، دانشمند برتر جهان اسلام و اساتید و پژوهشگران نمونه در سطح ملی می باشد.

دانشکده علوم مالی شامل سه گروه آموزشی : حسابداری، مدیریت مالی و ریاضیات مالی است که در 2 مقطع کارشناسی و کارشناسی ارشد دانشجو می پذیرد. این دانشکده از دیرباز موفق ترین قطب تخصصی حسابداری، حسابرسی، مالیاتی، حسابداری دولتی بوده است و اساتید مجرب و برترین های حرفه برای تدریس کاربردی مطالب مورد نیاز روز صنعت و حرفه به دانشجویان انتخاب می شوند که بهترین موید آن نیز فارغ التحصیلان کارآمد این دانشکده است که اکثرا در سمتهای اجرایی بالا در وزارتخانه ها، سازمان ها و مراکز اداری و اجرایی کشور مشغول کار هستند.

داﻧﺸﻜﺪه ﻓﻨﻲ و ﻣﻬﻨﺪﺳﻲ ﺑﻪ ﻣﻨﻈﻮر ﺗﺮﺑﻴﺖ ﻣﻬﻨﺪﺳﺎن ﺗﻮاﻧﻤﻨﺪ و ﺧﻼق ﺑﺎ ﺑﺎﻻﺗﺮﻳﻦ اﺳﺘﺎﻧﺪاردﻫﺎي آﻣﻮزﺷﻲ و ﭘﮋوﻫﺸﻲ، ﺟﻬﺖ آﻣﺎدهﺳﺎزي آﻧﺎن ﺑﺮاي اراﺋﻪ ﺧﺪﻣﺎت ﺣﺮﻓﻪ‌اي ﻣﺮﺗﺒﻂ ﺑﺎ ﺗﺨﺼﺺ ﺗأﺳﻴﺲ ﺷﺪه اﺳﺖ. این دانشکده در طول حیات خود، جوایز و افتخارات متعددی را در سطح بین المللی، ملی و استانی به دست آورده است.

دانشکده فیزیک در زمینه های پلاسما، اپتیک و لیزر، ماده چگال، نانو، فوتونیک، نجوم و کیهان شناسی، در سه مقطع کارشناسی، کارشناسی ارشد و دکتری فعالیت می کند. این دانشکده دارای 4 استاد، 2 دانشیار، 12 استادیار و یک مربی می باشد و از امکانات و تجهیزات پیشرفته آموزشی و پژوهشی بهره مند است.

دانشکده مدیریت و حسابداری دانشگاه خوارزمی به پتانسیل موجود در اعضاء هیئت علمی دانشگاه شکل گرفت و از بدو تاسیس در مقطع دکتری وکارشناسی ارشد در محل پردیس مرکزی تهران اقدام به پذیرش دانشجو نمود. پس از ادغام دانشگاه علوم اقتصادی با دانشگاه، دانشکده مدیریت با افزایش تعداد گروه ها و به تبع آن رشته های آموزشی و همچنین افزایش تعداد اعضای هیأت علمی و دانشجویان، با قدرت و قوت بیشتری به مسیر خود ادامه می دهد.